学校具有雄厚的科研实力，拥有南京工业大学材料化学工程国家重点实验室，南京工业大学国家大学科技园，国家生化工程研究中心[3]，国家特种分离膜工程技术研究中心，国家热管技术推广中心，省级重点实验室及省部级工程研究中心28个；拥有国家建筑工程设计甲级资质、国家建筑工程勘察乙级资质和国家建设工程监理甲级资质。
科技创新大楼欧阳平凯院士提出“工业生物技术”的概念，主持有关前沿科学问题的国家973计划项目；创建国家生化工程技术研究中心，形成的20多项专利技术已在社会企业得到应用。“工业生物技术”也已纳入国家中长期科技发展规划。2003年，南京工业大学成立了“一园两区”的大学科技园。2008年，南京工业大学的大学科技园被定为国家大学科技园。
南方有嘉木，工大育英才。南京工业大学具有百年办学历史，是一所以工为主的多科性百强名校。学校于2001年由原南京化工大学与原南京建筑工程学院合并组建而成，是江苏省省属重点高校。原南京化工大学的前身可追溯到创建于1902年的三江师范学堂；原南京建筑工程学院的前身可追溯到创建于1915年的同济医工学堂附设机师科。
